Answer
はい、可能です。異なるライセンスキーで1台のマシンに複数のPythonアプリをビルドすることが可能です。
ただしPyarmorのライセンスは製品に付与されるものであり、マシンや開発者に付与されるものではないので、1つのプロジェクトに属していないのであればその数だけライセンス購入が必要となります。（Pyarmor license is granted to product, not to a machine ｏr a developer.）
Pyarmorは1台のビルドマシンで複数のPythonアプリを難読化することは可能でしょうか？