Chromasは、DNA シーケンシングと解析のためのソフトウェアです。Chromasは、複数のシーケンスのアセンブリを必要としない単純な DNA シーケンシングプロジェクトのためのトレースビューアです。Chromasは、Applied Biosystems DNA シーケンサから .ab1 クロマトグラムファイルを開きます。他のシーケンサで作成された SCF および ZTR 形式のクロマトグラムファイルを開くこともできます。
ChromasPro は、Chromas の拡張版であり、より高度な機能を備えています。ChromasPro には、クロマトグラム、制限部位およびフラグメントマップ、開放読み枠マップを印刷する機能があります。NCBI ウェブサイトを介してヌクレオチドおよびタンパク質 BLAST 検索を実行することができます。ClustalW と連携して複数のアラインメントを実行することもできます。
ChromasProは、数百万塩基規模のアセンブリと基本的な配列編集・解析が可能な DNA シークエンシング用ソフトウェアです。Chromasは無料で利用可能で、Sangerシーケンサからのデータを組み立てることができます。また、454 および Illumina 次世代シーケンサからのデータも組み立てることができます 。
ChromasPro には以下の機能があります。
・Applied Biosystems .ab1、Staden Chromatogram (SCF および ZTR)、454 SFF、FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、SwissProt、GenPept、GCG RSF およびプレーンテキスト形式でシーケンスを開くことができます。
・.ab1、.scf、.fasta および .fastq 形式でシーケンスを保存することができます。
・グラフィカルインターフェイスを使用して重複するシーケンスを組み合わせ、コンセンサスを生成し、編集のために曖昧さを強調表示することができます。
・シーケンスアセンブリの改善のために低品質シーケンスを自動的に削除するために品質データを使用することができます。
・アセンブリの足場として参照シーケンスを使用することができます。
・制限部位およびフラグメントマップを生成し、カッター、ノンカッターおよびフラグメントをリストアップすることができます。
・G+C フレームプロットによって支援された開放読み枠マップを作成し、1クリックで ORF を翻訳することができます。
・クロマトグラム、制限部位およびフラグメントマップ、開放読み枠マップを印刷することができます。
・NCBI ウェブサイトを介してヌクレオチドおよびタンパク質 BLAST 検索を実行することができます。
・ClustalW と連携して複数のアラインメントを実行することもできます。
・シーケンスおよびクロマトグラムの反転・補完を行うことができます。
・完全一致または最適アラインメントによるシーケンスの検索を行うことができます。
・核酸配列の編集時に翻訳を表示することができます。
・逆翻訳を実行し、核酸の退化度合いをプロットすることができます。
・タンパク質の親水性および抗原性をプロットすることができます。
・クロマトグラムセクションの画像をコピーしてドキュメントやプレゼンテーションに貼り付けることができます。
【ライセンスについて】
永久ライセンスと年間ライセンスからお選びいただけます。
*ライセンスユーザーの以前のバージョンからのアップグレードは、無料です。
*Academic版もございます。（商業使用不可）
試用版ダウンロードはこちら(試用期間14日間)
メーカーの製品サイト
https://www.technelysium.com.au/
【種別】シェアウェア
【言語】英語
【動作環境】Windows
ChromasPro は、Chromas の拡張版であり、より高度な機能を備えています。ChromasPro には、クロマトグラム、制限部位およびフラグメントマップ、開放読み枠マップを印刷する機能があります。NCBI ウェブサイトを介してヌクレオチドおよびタンパク質 BLAST 検索を実行することができます。ClustalW と連携して複数のアラインメントを実行することもできます。
ChromasProは、数百万塩基規模のアセンブリと基本的な配列編集・解析が可能な DNA シークエンシング用ソフトウェアです。Chromasは無料で利用可能で、Sangerシーケンサからのデータを組み立てることができます。また、454 および Illumina 次世代シーケンサからのデータも組み立てることができます 。
ChromasPro には以下の機能があります。
・Applied Biosystems .ab1、Staden Chromatogram (SCF および ZTR)、454 SFF、FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、SwissProt、GenPept、GCG RSF およびプレーンテキスト形式でシーケンスを開くことができます。
・.ab1、.scf、.fasta および .fastq 形式でシーケンスを保存することができます。
・グラフィカルインターフェイスを使用して重複するシーケンスを組み合わせ、コンセンサスを生成し、編集のために曖昧さを強調表示することができます。
・シーケンスアセンブリの改善のために低品質シーケンスを自動的に削除するために品質データを使用することができます。
・アセンブリの足場として参照シーケンスを使用することができます。
・制限部位およびフラグメントマップを生成し、カッター、ノンカッターおよびフラグメントをリストアップすることができます。
・G+C フレームプロットによって支援された開放読み枠マップを作成し、1クリックで ORF を翻訳することができます。
・クロマトグラム、制限部位およびフラグメントマップ、開放読み枠マップを印刷することができます。
・NCBI ウェブサイトを介してヌクレオチドおよびタンパク質 BLAST 検索を実行することができます。
・ClustalW と連携して複数のアラインメントを実行することもできます。
・シーケンスおよびクロマトグラムの反転・補完を行うことができます。
・完全一致または最適アラインメントによるシーケンスの検索を行うことができます。
・核酸配列の編集時に翻訳を表示することができます。
・逆翻訳を実行し、核酸の退化度合いをプロットすることができます。
・タンパク質の親水性および抗原性をプロットすることができます。
・クロマトグラムセクションの画像をコピーしてドキュメントやプレゼンテーションに貼り付けることができます。
【ライセンスについて】
永久ライセンスと年間ライセンスからお選びいただけます。
*ライセンスユーザーの以前のバージョンからのアップグレードは、無料です。
*Academic版もございます。（商業使用不可）
試用版ダウンロードはこちら(試用期間14日間)
メーカーの製品サイト
https://www.technelysium.com.au/
【種別】シェアウェア
【言語】英語
【動作環境】Windows
